Changes

              
    

          
          
        
        

            
f
1
{
f
1
{
            
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL \", \"affiliation_02\": \"ETH\", 
2
  "author": "[{\"affiliation\": \"WSL \", \"affiliation_02\": \"ETH\", 
            
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
3
\"affiliation_03\": \"\", \"data_credit\": [\"collection\", 
            
4
\"publication\"], \"email\": \"roksolana.petrovska@gmail.com\", 
4
\"publication\"], \"email\": \"roksolana.petrovska@gmail.com\", 
            
5
\"given_name\": \"Roksolana\", \"identifier\": 
5
\"given_name\": \"Roksolana\", \"identifier\": 
            
6
\"0000-0002-1671-7730\", \"name\": \"Petrovska\"}]",
6
\"0000-0002-1671-7730\", \"name\": \"Petrovska\"}]",
            
7
  "author_email": null,
7
  "author_email": null,
            
8
  "creator_user_id": "cebf55c4-ca36-441d-865c-df4f3b7ec4e4",
8
  "creator_user_id": "cebf55c4-ca36-441d-865c-df4f3b7ec4e4",
            
9
  "date": "[{\"date\": \"2018-05-04\", \"date_type\": \"collected\", 
9
  "date": "[{\"date\": \"2018-05-04\", \"date_type\": \"collected\", 
            
10
\"end_date\": \"2018-07-15\"}]",
10
\"end_date\": \"2018-07-15\"}]",
            
11
  "doi": "10.16904/envidat.258",
11
  "doi": "10.16904/envidat.258",
            
12
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"SERI\", 
12
  "funding": "[{\"grant_number\": \"\", \"institution\": \"SERI\", 
            
13
\"institution_url\": \"\"}]",
13
\"institution_url\": \"\"}]",
            
14
  "groups": [],
14
  "groups": [],
            
15
  "id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
15
  "id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
            
16
  "isopen": true,
16
  "isopen": true,
            
17
  "language": "en",
17
  "language": "en",
            
18
  "license_id": "cc-by-sa",
18
  "license_id": "cc-by-sa",
            
19
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike 
19
  "license_title": "Creative Commons Attribution Share-Alike 
            
20
(CC-BY-SA)",
20
(CC-BY-SA)",
            
21
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/",
21
  "license_url": "https://creativecommons.org/licenses/by-sa/4.0/",
            
22
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
22
  "maintainer": "{\"affiliation\": \"WSL\", \"email\": 
            
23
\"roksolana.petrovska@gmail.com\", \"given_name\": \"Roksolana\", 
23
\"roksolana.petrovska@gmail.com\", \"given_name\": \"Roksolana\", 
            
24
\"identifier\": \"0000-0002-1671-7730\", \"name\": \"Petrovska\"}",
24
\"identifier\": \"0000-0002-1671-7730\", \"name\": \"Petrovska\"}",
            
25
  "maintainer_email": null,
25
  "maintainer_email": null,
            
26
  "metadata_created": "2021-11-04T16:03:34.690338",
26
  "metadata_created": "2021-11-04T16:03:34.690338",
            
n
27
  "metadata_modified": "2021-11-04T16:23:53.208904",
n
27
  "metadata_modified": "2021-11-04T16:41:24.578516",
            
28
  "name": "mortality-of-regeneration-acer-spp-and-fagus-sylvatica",
28
  "name": "mortality-of-regeneration-acer-spp-and-fagus-sylvatica",
            
29
  "notes": "### One individual per species, vitality class (low and 
29
  "notes": "### One individual per species, vitality class (low and 
            
30
high) and height class (eight classes: 0\u201310, 11\u201320, 
30
high) and height class (eight classes: 0\u201310, 11\u201320, 
            
31
21\u201335, 36\u201360, 61\u201390, 91\u2013130, 131\u2013200 and 
31
21\u201335, 36\u201360, 61\u201390, 91\u2013130, 131\u2013200 and 
            
32
201\u2013500 cm) was randomly selected and harvested in each of the 
32
201\u2013500 cm) was randomly selected and harvested in each of the 
            
33
six plots. This resulted in a sample of 82, 80 and 89 living 
33
six plots. This resulted in a sample of 82, 80 and 89 living 
            
34
individuals of A. platanoides, A. pseudoplatanus and F. sylvatica, 
34
individuals of A. platanoides, A. pseudoplatanus and F. sylvatica, 
            
35
respectively. \r\n\r\n### Additionally stems of dead Acer spp. and F. 
35
respectively. \r\n\r\n### Additionally stems of dead Acer spp. and F. 
            
36
sylvatica trees that had died within the last three years 
36
sylvatica trees that had died within the last three years 
            
37
(2015\u20132018) were randomly harvested, matching the height classes 
37
(2015\u20132018) were randomly harvested, matching the height classes 
            
38
of the harvested living trees wherever possible. In total, 179 dead 
38
of the harvested living trees wherever possible. In total, 179 dead 
            
39
young trees (60 A. platanoides, 72 A. pseudoplatanus and 47 F. 
39
young trees (60 A. platanoides, 72 A. pseudoplatanus and 47 F. 
            
40
sylvatica) were collected. \r\n\r\n## Variables:\r\n* species_code: 
40
sylvatica) were collected. \r\n\r\n## Variables:\r\n* species_code: 
            
41
a_pla - Acer platanoides, a_pse - Acer pseudoplatanus, f_syl - Fagus 
41
a_pla - Acer platanoides, a_pse - Acer pseudoplatanus, f_syl - Fagus 
            
42
sylvatica\r\n* species: as above\r\n* dummy: 0 - living individual, 1 
42
sylvatica\r\n* species: as above\r\n* dummy: 0 - living individual, 1 
            
43
- dead individual \r\n* LAR_cm2_g: leaf area ratio or ratio of leaf 
43
- dead individual \r\n* LAR_cm2_g: leaf area ratio or ratio of leaf 
            
44
area to total plant biomass, [cm2/g]\r\n* tree_age: in years\r\n* 
44
area to total plant biomass, [cm2/g]\r\n* tree_age: in years\r\n* 
            
45
avg_ring_micron: average width of the last 5 rings in tree life 
45
avg_ring_micron: average width of the last 5 rings in tree life 
            
46
excluding the last ring\t\r\n* dry_mass_g: aboveground and belowground 
46
excluding the last ring\t\r\n* dry_mass_g: aboveground and belowground 
            
47
biomass\r\n* DLI: direct light index (measured only under living 
47
biomass\r\n* DLI: direct light index (measured only under living 
            
48
individuals)\r\n* BLI: diffuse light index (measured only under living 
48
individuals)\r\n* BLI: diffuse light index (measured only under living 
            
49
individuals)\t\r\n* GLI: global light index",
49
individuals)\t\r\n* GLI: global light index",
            
50
  "num_resources": 2,
50
  "num_resources": 2,
            
51
  "num_tags": 7,
51
  "num_tags": 7,
            
52
  "organization": {
52
  "organization": {
            
53
    "approval_status": "approved",
53
    "approval_status": "approved",
            
54
    "created": "2018-05-28T16:14:38.566274",
54
    "created": "2018-05-28T16:14:38.566274",
            
55
    "description": "We study stand dynamics and how they can be 
55
    "description": "We study stand dynamics and how they can be 
            
56
influenced by man.  We thereby focus on the following topics:\r\n\r\n* 
56
influenced by man.  We thereby focus on the following topics:\r\n\r\n* 
            
57
Growth and yield research\r\n\r\n* Forest dynamics in forest 
57
Growth and yield research\r\n\r\n* Forest dynamics in forest 
            
58
reserves\r\n\r\n* Virgin forest research in the Ukraine\r\n\r\n* 
58
reserves\r\n\r\n* Virgin forest research in the Ukraine\r\n\r\n* 
            
59
Adaptation of forest trees to climate change\r\n\r\n* Close-to-nature 
59
Adaptation of forest trees to climate change\r\n\r\n* Close-to-nature 
            
60
silvicultural strategies\r\n\r\n* Forest succession and young forest 
60
silvicultural strategies\r\n\r\n* Forest succession and young forest 
            
61
tending\r\n\r\n* Forest-ungulate interactions and browsing\r\n\r\nWe 
61
tending\r\n\r\n* Forest-ungulate interactions and browsing\r\n\r\nWe 
            
62
maintain and manage a net of long-term permanent plots and use the 
62
maintain and manage a net of long-term permanent plots and use the 
            
63
data in simulation models of forest dynamics. Our research contributes 
63
data in simulation models of forest dynamics. Our research contributes 
            
64
to an ecologically, economically and socially sustainable forest 
64
to an ecologically, economically and socially sustainable forest 
            
65
management.",
65
management.",
            
66
    "id": "29c6cc65-4b0e-4fe5-9d4a-f1e370191789",
66
    "id": "29c6cc65-4b0e-4fe5-9d4a-f1e370191789",
            
67
    "image_url": "2018-09-10-072849.510334BuWselection.jpg",
67
    "image_url": "2018-09-10-072849.510334BuWselection.jpg",
            
68
    "is_organization": true,
68
    "is_organization": true,
            
69
    "name": "stand-dynamics-and-silviculture",
69
    "name": "stand-dynamics-and-silviculture",
            
70
    "state": "active",
70
    "state": "active",
            
71
    "title": "Stand Dynamics and Silviculture",
71
    "title": "Stand Dynamics and Silviculture",
            
72
    "type": "organization"
72
    "type": "organization"
            
73
  },
73
  },
            
74
  "owner_org": "29c6cc65-4b0e-4fe5-9d4a-f1e370191789",
74
  "owner_org": "29c6cc65-4b0e-4fe5-9d4a-f1e370191789",
            
75
  "private": false,
75
  "private": false,
            
76
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
76
  "publication": "{\"publication_year\": \"2021\", \"publisher\": 
            
77
\"EnviDat\"}",
77
\"EnviDat\"}",
            
t
78
  "publication_state": "pub_pending",
t
78
  "publication_state": "approved",
            
79
  "related_datasets": "",
79
  "related_datasets": "",
            
80
  "related_publications": "### Petrovska R., Bugmann H., Hobi M.L., 
80
  "related_publications": "### Petrovska R., Bugmann H., Hobi M.L., 
            
81
Ghosh S., Brang P. 2021. Survival time and mortality rate of 
81
Ghosh S., Brang P. 2021. Survival time and mortality rate of 
            
82
regeneration in the deep shade of a primeval beech forest, European 
82
regeneration in the deep shade of a primeval beech forest, European 
            
83
Journal of Forest Research, DOI: 10.1007/s10342-021-01427-3",
83
Journal of Forest Research, DOI: 10.1007/s10342-021-01427-3",
            
84
  "relationships_as_object": [],
84
  "relationships_as_object": [],
            
85
  "relationships_as_subject": [],
85
  "relationships_as_subject": [],
            
86
  "resource_type": "datapaper",
86
  "resource_type": "datapaper",
            
87
  "resource_type_general": "datapaper",
87
  "resource_type_general": "datapaper",
            
88
  "resources": [
88
  "resources": [
            
89
    {
89
    {
            
90
      "cache_last_updated": null,
90
      "cache_last_updated": null,
            
91
      "cache_url": null,
91
      "cache_url": null,
            
92
      "created": "2021-11-04T16:06:51.802328",
92
      "created": "2021-11-04T16:06:51.802328",
            
93
      "description": "Acer platanoides, Acer pseudoplatanus and Fagus 
93
      "description": "Acer platanoides, Acer pseudoplatanus and Fagus 
            
94
sylvatica living and dead juveniles (0-500 cm in height) grown in the 
94
sylvatica living and dead juveniles (0-500 cm in height) grown in the 
            
95
deep shade of a prime beech-dominated forest.",
95
deep shade of a prime beech-dominated forest.",
            
96
      "doi": "",
96
      "doi": "",
            
97
      "format": "CSV",
97
      "format": "CSV",
            
98
      "hash": "",
98
      "hash": "",
            
99
      "id": "37fb69d9-c553-4931-89ba-31857ac15c04",
99
      "id": "37fb69d9-c553-4931-89ba-31857ac15c04",
            
100
      "last_modified": null,
100
      "last_modified": null,
            
101
      "metadata_modified": "2021-11-04T16:06:51.776208",
101
      "metadata_modified": "2021-11-04T16:06:51.776208",
            
102
      "mimetype": null,
102
      "mimetype": null,
            
103
      "mimetype_inner": null,
103
      "mimetype_inner": null,
            
104
      "name": "Mortality of regeneration",
104
      "name": "Mortality of regeneration",
            
105
      "package_id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
105
      "package_id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
            
106
      "position": 0,
106
      "position": 0,
            
107
      "publication_state": "",
107
      "publication_state": "",
            
108
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
108
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
109
\"kb\"}",
109
\"kb\"}",
            
110
      "resource_type": null,
110
      "resource_type": null,
            
111
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
111
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
112
\"shared_secret\": \"\"}",
112
\"shared_secret\": \"\"}",
            
113
      "size": 60209,
113
      "size": 60209,
            
114
      "state": "active",
114
      "state": "active",
            
115
      "url": 
115
      "url": 
            
116
e/resource/37fb69d9-c553-4931-89ba-31857ac15c04/download/imputed.csv",
116
e/resource/37fb69d9-c553-4931-89ba-31857ac15c04/download/imputed.csv",
            
117
      "url_type": "upload"
117
      "url_type": "upload"
            
118
    },
118
    },
            
119
    {
119
    {
            
120
      "cache_last_updated": null,
120
      "cache_last_updated": null,
            
121
      "cache_url": null,
121
      "cache_url": null,
            
122
      "created": "2021-11-04T16:09:15.576429",
122
      "created": "2021-11-04T16:09:15.576429",
            
123
      "description": "The R-script of survival analysis for 
123
      "description": "The R-script of survival analysis for 
            
124
accelerated failure time model",
124
accelerated failure time model",
            
125
      "doi": "",
125
      "doi": "",
            
126
      "format": "r script (flat-ascii text)",
126
      "format": "r script (flat-ascii text)",
            
127
      "hash": "",
127
      "hash": "",
            
128
      "id": "6ff5b7a2-6662-41ab-8c2d-68f688cde189",
128
      "id": "6ff5b7a2-6662-41ab-8c2d-68f688cde189",
            
129
      "last_modified": null,
129
      "last_modified": null,
            
130
      "metadata_modified": "2021-11-04T16:09:15.549982",
130
      "metadata_modified": "2021-11-04T16:09:15.549982",
            
131
      "mimetype": null,
131
      "mimetype": null,
            
132
      "mimetype_inner": null,
132
      "mimetype_inner": null,
            
133
      "name": "Survival_AFT_R_script",
133
      "name": "Survival_AFT_R_script",
            
134
      "package_id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
134
      "package_id": "8d9df0cd-f20c-423f-a4ab-71fc213871de",
            
135
      "position": 1,
135
      "position": 1,
            
136
      "publication_state": "",
136
      "publication_state": "",
            
137
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
137
      "resource_size": "{\"size_value\": \"\", \"size_units\": 
            
138
\"kb\"}",
138
\"kb\"}",
            
139
      "resource_type": null,
139
      "resource_type": null,
            
140
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
140
      "restricted": "{\"level\": \"public\", \"allowed_users\": \"\", 
            
141
\"shared_secret\": \"\"}",
141
\"shared_secret\": \"\"}",
            
142
      "size": 18015,
142
      "size": 18015,
            
143
      "state": "active",
143
      "state": "active",
            
144
      "url": 
144
      "url": 
            
145
urce/6ff5b7a2-6662-41ab-8c2d-68f688cde189/download/survival_script.r",
145
urce/6ff5b7a2-6662-41ab-8c2d-68f688cde189/download/survival_script.r",
            
146
      "url_type": "upload"
146
      "url_type": "upload"
            
147
    }
147
    }
            
148
  ],
148
  ],
            
149
  "spatial": 
149
  "spatial": 
            
150
55853,48.166371652237295],[23.581741307862103,48.166371652237295]]]}",
150
55853,48.166371652237295],[23.581741307862103,48.166371652237295]]]}",
            
151
  "spatial_info": "Ukraine, the Uholka-Shyrokyi Luh reserve",
151
  "spatial_info": "Ukraine, the Uholka-Shyrokyi Luh reserve",
            
152
  "state": "active",
152
  "state": "active",
            
153
  "subtitle": "",
153
  "subtitle": "",
            
154
  "tags": [
154
  "tags": [
            
155
    {
155
    {
            
156
      "display_name": "ACER",
156
      "display_name": "ACER",
            
157
      "id": "eab34bc4-88c5-4659-839a-070d85f3d8b5",
157
      "id": "eab34bc4-88c5-4659-839a-070d85f3d8b5",
            
158
      "name": "ACER",
158
      "name": "ACER",
            
159
      "state": "active",
159
      "state": "active",
            
160
      "vocabulary_id": null
160
      "vocabulary_id": null
            
161
    },
161
    },
            
162
    {
162
    {
            
163
      "display_name": "DOMINANCE",
163
      "display_name": "DOMINANCE",
            
164
      "id": "fc85f7c8-e9db-4d76-80dc-3c2a14ef2576",
164
      "id": "fc85f7c8-e9db-4d76-80dc-3c2a14ef2576",
            
165
      "name": "DOMINANCE",
165
      "name": "DOMINANCE",
            
166
      "state": "active",
166
      "state": "active",
            
167
      "vocabulary_id": null
167
      "vocabulary_id": null
            
168
    },
168
    },
            
169
    {
169
    {
            
170
      "display_name": "FAGUS",
170
      "display_name": "FAGUS",
            
171
      "id": "587974ab-b048-413d-aedb-bfe8c6713a73",
171
      "id": "587974ab-b048-413d-aedb-bfe8c6713a73",
            
172
      "name": "FAGUS",
172
      "name": "FAGUS",
            
173
      "state": "active",
173
      "state": "active",
            
174
      "vocabulary_id": null
174
      "vocabulary_id": null
            
175
    },
175
    },
            
176
    {
176
    {
            
177
      "display_name": "LAR",
177
      "display_name": "LAR",
            
178
      "id": "0ed51c22-2d11-4d61-a0d9-10e8205fa23a",
178
      "id": "0ed51c22-2d11-4d61-a0d9-10e8205fa23a",
            
179
      "name": "LAR",
179
      "name": "LAR",
            
180
      "state": "active",
180
      "state": "active",
            
181
      "vocabulary_id": null
181
      "vocabulary_id": null
            
182
    },
182
    },
            
183
    {
183
    {
            
184
      "display_name": "MORTALITY RATE",
184
      "display_name": "MORTALITY RATE",
            
185
      "id": "b2f2fb2c-1121-4c44-9d71-d7e522d30743",
185
      "id": "b2f2fb2c-1121-4c44-9d71-d7e522d30743",
            
186
      "name": "MORTALITY RATE",
186
      "name": "MORTALITY RATE",
            
187
      "state": "active",
187
      "state": "active",
            
188
      "vocabulary_id": null
188
      "vocabulary_id": null
            
189
    },
189
    },
            
190
    {
190
    {
            
191
      "display_name": "REGENERATION",
191
      "display_name": "REGENERATION",
            
192
      "id": "26924039-44a6-4dfc-aeac-499d9c197593",
192
      "id": "26924039-44a6-4dfc-aeac-499d9c197593",
            
193
      "name": "REGENERATION",
193
      "name": "REGENERATION",
            
194
      "state": "active",
194
      "state": "active",
            
195
      "vocabulary_id": null
195
      "vocabulary_id": null
            
196
    },
196
    },
            
197
    {
197
    {
            
198
      "display_name": "SHADE TOLERANCE",
198
      "display_name": "SHADE TOLERANCE",
            
199
      "id": "259a60f2-1576-4145-b0b6-287170560aeb",
199
      "id": "259a60f2-1576-4145-b0b6-287170560aeb",
            
200
      "name": "SHADE TOLERANCE",
200
      "name": "SHADE TOLERANCE",
            
201
      "state": "active",
201
      "state": "active",
            
202
      "vocabulary_id": null
202
      "vocabulary_id": null
            
203
    }
203
    }
            
204
  ],
204
  ],
            
205
  "title": "Mortality of regeneration: Acer spp. and Fagus sylvatica",
205
  "title": "Mortality of regeneration: Acer spp. and Fagus sylvatica",
            
206
  "type": "dataset",
206
  "type": "dataset",
            
207
  "url": null,
207
  "url": null,
            
208
  "version": "1.0"
208
  "version": "1.0"
            
209
}
209
}